Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MCTP1Q6DN14 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MCTP1Q6DN14 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms