Protein–RNA interactions for Protein: Q676U5

ATG16L1, Autophagy-related protein 16-1, humanhuman

Predictions only

Length 607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L1Q676U5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ATG16L1Q676U5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
ATG16L1Q676U5 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms