Protein–RNA interactions for Protein: Q66GS9

CEP135, Centrosomal protein of 135 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP135Q66GS9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CEP135Q66GS9 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP135Q66GS9 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP135Q66GS9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP135Q66GS9 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP135Q66GS9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP135Q66GS9 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP135Q66GS9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP135Q66GS9 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP135Q66GS9 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP135Q66GS9 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CEP135Q66GS9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms