Protein–RNA interactions for Protein: Q5VYV7

SLX4IP, Protein SLX4IP, humanhuman

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLX4IPQ5VYV7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SLX4IPQ5VYV7 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SLX4IPQ5VYV7 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms