Protein–RNA interactions for Protein: Q5VX71

SUSD4, Sushi domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD4Q5VX71 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SUSD4Q5VX71 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SUSD4Q5VX71 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms