Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWM3

PRAMEF18, PRAME family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF18Q5VWM3 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
PRAMEF18Q5VWM3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRAMEF18Q5VWM3 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms