Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTR2

RNF20, E3 ubiquitin-protein ligase BRE1A, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF20Q5VTR2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
RNF20Q5VTR2 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
RNF20Q5VTR2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms