Protein–RNA interactions for Protein: Q5T7P6

TMEM78, Transmembrane protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM78Q5T7P6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TMEM78Q5T7P6 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms