Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZQ8

CELF3, CUGBP Elav-like family member 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF3Q5SZQ8 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CELF3Q5SZQ8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CELF3Q5SZQ8 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms