Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PCID2Q5JVF3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PCID2Q5JVF3 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms