Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RPL39P5Q59GN2 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RPL39P5Q59GN2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms