Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SDK2Q58EX2 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SDK2Q58EX2 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms