Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HSD17B12Q53GQ0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms