Protein–RNA interactions for Protein: Q53G59

KLHL12, Kelch-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL12Q53G59 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
KLHL12Q53G59 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
KLHL12Q53G59 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms