Protein–RNA interactions for Protein: Q52WX2

SBK1, Serine/threonine-protein kinase SBK1, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBK1Q52WX2 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SBK1Q52WX2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SBK1Q52WX2 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms