Protein–RNA interactions for Protein: Q4G163

FBXO43, F-box only protein 43, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO43Q4G163 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
FBXO43Q4G163 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms