Protein–RNA interactions for Protein: Q3YBR2

TBRG1, Transforming growth factor beta regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBRG1Q3YBR2 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TBRG1Q3YBR2 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
TBRG1Q3YBR2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms