Protein–RNA interactions for Protein: Q3SYG4

BBS9, Protein PTHB1, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS9Q3SYG4 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
BBS9Q3SYG4 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
BBS9Q3SYG4 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms