Protein–RNA interactions for Protein: Q3LHN1

KRTAP21-3, Keratin-associated protein 21-3, humanhuman

Predictions only

Length 58 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-3Q3LHN1 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
KRTAP21-3Q3LHN1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
KRTAP21-3Q3LHN1 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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