Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF8Q3BBV2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF8Q3BBV2 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF8Q3BBV2 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF8Q3BBV2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF8Q3BBV2 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF8Q3BBV2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF8Q3BBV2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF8Q3BBV2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF8Q3BBV2 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF8Q3BBV2 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF8Q3BBV2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF8Q3BBV2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF8Q3BBV2 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF8Q3BBV2 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms