Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
LRRFIP1Q32MZ4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LRRFIP1Q32MZ4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms