Protein–RNA interactions for Protein: Q2Q1W2

TRIM71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 868 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM71Q2Q1W2 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TRIM71Q2Q1W2 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TRIM71Q2Q1W2 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms