Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCDC27Q2M243 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC27Q2M243 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms