Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CSPP1Q1MSJ5 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms