Protein–RNA interactions for Protein: Q1ED39

KNOP1, Lysine-rich nucleolar protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNOP1Q1ED39 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KNOP1Q1ED39 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
KNOP1Q1ED39 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
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