Protein–RNA interactions for Protein: Q16832

DDR2, Discoidin domain-containing receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR2Q16832 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DDR2Q16832 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
DDR2Q16832 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
DDR2Q16832 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DDR2Q16832 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DDR2Q16832 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DDR2Q16832 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR2Q16832 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR2Q16832 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DDR2Q16832 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DDR2Q16832 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms