Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTPROQ16827 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTPROQ16827 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
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