Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATP2B3Q16720 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATP2B3Q16720 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
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