Protein–RNA interactions for Protein: Q16134

ETFDH, Electron transfer flavoprotein-ubiquinone oxidoreductase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETFDHQ16134 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ETFDHQ16134 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms