Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ZFHX3Q15911 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ZFHX3Q15911 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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