Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ITSN1Q15811 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ITSN1Q15811 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
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