Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ZNHIT3Q15649 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ZNHIT3Q15649 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms