Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TRIP10Q15642 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms