Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.79
TCEA2Q15560 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
TCEA2Q15560 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
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