Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CDSNQ15517 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CDSNQ15517 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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