Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SEC23BQ15437 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SEC23BQ15437 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SEC23BQ15437 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SEC23BQ15437 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
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SEC23BQ15437 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SEC23BQ15437 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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SEC23BQ15437 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
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SEC23BQ15437 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SEC23BQ15437 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
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