Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SF3B3Q15393 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SF3B3Q15393 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
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