Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

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Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
PTPRKQ15262 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.66■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.65■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
PTPRKQ15262 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
PTPRKQ15262 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
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