Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
PRKD1Q15139 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
PRKD1Q15139 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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