Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PDK3Q15120 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
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