Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PDCD1Q15116 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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