Protein–RNA interactions for Protein: Q15035

TRAM2, Translocating chain-associated membrane protein 2, humanhuman

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Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM2Q15035 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TRAM2Q15035 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
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