Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
HERC3Q15034 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
HERC3Q15034 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
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