Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NCAPHQ15003 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
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