Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC28.2■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SHPRHQ149N8 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
SHPRHQ149N8 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
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