Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
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RAB39AQ14964 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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RAB39AQ14964 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
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RAB39AQ14964 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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RAB39AQ14964 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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RAB39AQ14964 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
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RAB39AQ14964 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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RAB39AQ14964 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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RAB39AQ14964 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
RAB39AQ14964 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
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RAB39AQ14964 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
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RAB39AQ14964 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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RAB39AQ14964 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
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RAB39AQ14964 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
RAB39AQ14964 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
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