Protein–RNA interactions for Protein: Q14714

SSPN, Sarcospan, humanhuman

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Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSPNQ14714 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SSPNQ14714 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
SSPNQ14714 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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