Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
RFTN1Q14699 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
RFTN1Q14699 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
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