Protein–RNA interactions for Protein: Q14676

MDC1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDC1Q14676 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MDC1Q14676 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MDC1Q14676 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms