Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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RBM39Q14498 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
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RBM39Q14498 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
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RBM39Q14498 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RBM39Q14498 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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